Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRRC1Q96M27 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms