Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNBD2Q96M20 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms