Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM44Q96DX7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms