Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms