Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC47Q96A33 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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