Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms