Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RABGGTAQ92696 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RABGGTAQ92696 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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RABGGTAQ92696 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGGTAQ92696 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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