Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AMER3Q8N944 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms