Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC82Q8N4S0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC82Q8N4S0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms