Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SCGB1D4Q6XE38 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SCGB1D4Q6XE38 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms