Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSAG1Q6PB30 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms