Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms