Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG16L1Q676U5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms