Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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FAM78BQ5VT40 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM78BQ5VT40 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FAM78BQ5VT40 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FAM78BQ5VT40 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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