Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms