Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD5Q5TGI4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD5Q5TGI4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms