Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND3Q5T5X7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms