Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCID2Q5JVF3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCID2Q5JVF3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms