Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRNQ4KMQ1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms