Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TBRG1Q3YBR2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms