Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q1T7F1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q1T7F1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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