Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SGCAQ16586 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCAQ16586 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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