Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC18A3Q16572 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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