Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP6AP1Q15904 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms