Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPTX1Q15818 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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