Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1CQ15572 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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