Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PTPAQ15257 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPAQ15257 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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