Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK3Q15120 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms