Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NCF4Q15080 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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