Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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UBE4AQ14139 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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UBE4AQ14139 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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UBE4AQ14139 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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UBE4AQ14139 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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UBE4AQ14139 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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UBE4AQ14139 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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UBE4AQ14139 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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UBE4AQ14139 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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UBE4AQ14139 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE4AQ14139 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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