Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PKP1Q13835 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP1Q13835 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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