Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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PRPF4BQ13523 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRPF4BQ13523 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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