Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BFSP2Q13515 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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