Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAF1AQ13111 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAF1AQ13111 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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