Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIK2Q13002 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GRIK2Q13002 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms