Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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FOXC1Q12948 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FOXC1Q12948 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXC1Q12948 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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