Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NCBP1Q09161 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCBP1Q09161 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NCBP1Q09161 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCBP1Q09161 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms