Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBBP4Q09028 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBBP4Q09028 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms