Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PAX8Q06710 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms