Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNB3Q05901 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNB3Q05901 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms