Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN12Q05209 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN12Q05209 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms