Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NHLH2Q02577 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms