Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMF1P82094 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMF1P82094 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMF1P82094 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMF1P82094 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMF1P82094 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMF1P82094 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms