Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERVFRD-1P60508 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms