Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPK4P57078 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms