Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKX2-5P52952 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKX2-5P52952 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms