Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA4P52798 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms