Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TNNT2P45379 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNT2P45379 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms