Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECI1P42126 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECI1P42126 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECI1P42126 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECI1P42126 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECI1P42126 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECI1P42126 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECI1P42126 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECI1P42126 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ECI1P42126 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ECI1P42126 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ECI1P42126 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ECI1P42126 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ECI1P42126 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ECI1P42126 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ECI1P42126 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ECI1P42126 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ECI1P42126 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ECI1P42126 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ECI1P42126 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ECI1P42126 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms