Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZEB1P37275 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZEB1P37275 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms